ये दस्तावेज, जिन्हें सुरक्षित रूप से संग्रहीत किया जाना था, पिछले गर्मियों में गायब हो गए, जिससे हेग में एजेंसी के मुख्यालय के भीतर हलचल हुई। एक आंतरिक जांच से पता चला कि अतिरिक्त फाइलें भी गायब थीं। कुछ फाइलें बाद में हेग में एक नागरिक द्वारा पाई गईं। इस घटना को अत्यधिक गोपनीय एचआर दस्तावेजों से जुड़ा एक गंभीर सुरक्षा और डेटा उल्लंघन के रूप में देखा जाता है। यह स्पष्ट नहीं है कि फाइलों को उनके सुरक्षित स्थान से कैसे हटाया गया था। उल्लंघन के बाद, मानव संसाधन के प्रमुख, मैसिमिलियानो बेटिन को प्रशासनिक छुट्टी पर रखा गया था। यूरोपोल, एक प्रमुख एजेंसी जो अंतरराष्ट्रीय कानून प्रवर्तन गतिविधियों का समन्वय करती है, ने चल रही आंतरिक जांच पर कोई टिप्पणी नहीं की है। उल्लंघन एजेंसी में आंतरिक सुरक्षा उपायों और डेटा सुरक्षा के बारे में चिंताएं पैदा करता है।